Zákon ani jiný prováděcí předpis hlasování o protinávrzích neupravuje. Pořadí hlasování o jednotlivých variantách je v zásadě organizační otázka, na kterou neexistuje univerzální odpověď. Doporučujeme upravit postup hlasování o protinávrzích v jednacím řádu. Zastupitelstvo obce vydává jednací řád usnesením. Postup při jeho přijímání je stejný jako u každého jiného usnesení. 

Podle výkladové praxe Ministerstva vnitra se obvykle hlasuje nejprve o protinávrhu a až poté o původním návrhu usnesení. Pokud protinávrh získá nadpoloviční většinu hlasů všech členů zastupitelstva obce, o původním návrhu už hlasovat není třeba. Pokud zastupitelstvo nejprve přijalo původní návrh nadpoloviční většinou všech svých členů a o protinávrhu pak vůbec nehlasovalo, nelze z toho podle našeho názoru dovodit neplatnost přijetí usnesení k původnímu návrhu. Je důležité, aby zastupitelé znali všechny možnosti a byli o nich řádně informováni už před hlasováním o první variantě.